傳統(tǒng)的菌落計數(shù)方法費時費力并且錯誤率較大，是一種全人工操作的方法。

　　現(xiàn)在隨著科技的進步，菌落計數(shù)技術(shù)日趨完善。主要體現(xiàn)在配置越來越高，功能越來越全。計數(shù)的速度越來越快，準確性也越來越精準。具體體現(xiàn)在下面幾個方面:

　　1、成像方面，傳統(tǒng)的手動菌落計數(shù)器，使用的是放大鏡，一般可放大1.7倍到3倍?，F(xiàn)在使用的菌落計數(shù)器已經(jīng)具有了圖片拍攝功能，而且CCD的規(guī)格越來越高，現(xiàn)在市場上銷售的儀器所配置的CCD規(guī)格是300萬到1000萬像素不等，分辨率也從原來的0.08mm增強到了現(xiàn)在的0.01mm，圖像清晰度大大提高。另外應基層微生物實驗室的使用需求，還增加了圖像特性獲取功能。

　　2、圖像處理功能，具有圖像調(diào)節(jié)，圖像增強，圖像濾波，邊緣檢測，形態(tài)學運算等，這些都是傳統(tǒng)的菌落計數(shù)器所沒有的。

　　3、在統(tǒng)計功能方面，不再局限于傳統(tǒng)的數(shù)量統(tǒng)計?，F(xiàn)在市場上出現(xiàn)的全自動菌落計數(shù)器，已經(jīng)增加了一些智能識別技術(shù)，可全皿菌落統(tǒng)計，區(qū)域選擇統(tǒng)計，鼠標點擊統(tǒng)計，排污區(qū)域計數(shù)，直徑分類統(tǒng)計，顏色識別統(tǒng)計等。更先進的全自動菌落計數(shù)器還帶有自動雜質(zhì)剔除，菌落粘連分割大腸桿菌技術(shù)等等。

　　4、測量功能和抑菌圈自動測量方面也是原來的菌落計數(shù)器所沒有，更有先進的儀器已經(jīng)具有了藥敏分析功能。不過，這種菌落計數(shù)器多用在微生物實驗室等數(shù)據(jù)要求較高的領域，價格也不便宜，市場價多在8，9萬左右。

　　5、在數(shù)據(jù)庫的處理方面，較傳統(tǒng)的菌落計數(shù)器，增加了數(shù)據(jù)存儲，智能查詢，數(shù)據(jù)導出等，有的還可以設置操作者使用權(quán)限，數(shù)據(jù)修改權(quán)限設置等，使測量的數(shù)據(jù)更加安全。同時，還可以在線編輯，報表打印。